Взято: http://www.4root.org/software/linux/ftp-server-proftpd-vsftpd-i-skrytye-fajly.html

Включить показ скрытых файлов (начинающие на ".") в листинге фтп серверов можно следующим образом

Vsftpd

Дописываем строки

# Show hidden files
force_dot_files=YES

Proftpd

Меняем значение директивы

ListOptions                     "-a"

Радуемся жизни =)